Ciste je potrebno zdraviti, ker lahko povzročajo bolečine, lahko se širijo in s tem povzročajo propadanje kosti, ogrožajo lahko zdrave zobe. Zdravljenje cist je odvisno od njihovega položaja in velikosti. Cisto najbolj pogosto odstranimo v celoti s kirurškim postopkom. V primeru velikih cist pa je zdravljenje bolj komplicirano in lahko poteka več mesecev, kjer se predhodno cisto dekompresira, ko pa se ta zmanjša, pa še kirurško odstrani.